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西北军区总部设在伊犁，防守区域包括新疆、青海、甘肃三省，兵员以原帝国一军（1、2、101师。独立重炮旅）为基础进行扩充。军区司令徐军，副司令郑可桐、魏山，参谋长为刘文南。
蒙古军区总部设在库伦（今蒙古首都乌兰巴托），防守范围为蒙古全境，以原帝国二军（35、202，第一独立炮兵团）为基础进行扩充。军区司令王凡，副司令袁杰、冯相华，参谋长为吴佩孚。
东北军区总部设在哈城（今哈尔滨），防守范围包括东北三省以及朝鲜半岛，兵员以原帝国三军4102，8师（原卫二师）和朝鲜游击队为基础进行扩充，军区司令韩兴华，副司令刘成良、古大力，参谋长薛庆晓。潘义改任日本、朝鲜两属国行政总督。
西南军区总部设在桂林府（清末广西治所），防守范围包括云、贵、川、桂四省以及印度支那三国，兵员以第四军（6、7、420师）为基础扩充。军区司令刘永福，副司令为刘正南、冯相华，参谋长给正在军校受训地丁槐留着，而冯子才调任全国宪兵司令。
东太平洋军区总部设在珍珠港，守卫夏威夷附近岛屿与海域的安全。海军方面以东太平洋舰队（原卫戍舰队）为基础，陆军方面以海军陆战2（留守的卫四师改编）为基础。司令齐红日，副司令高达龙（原卫四师师长，分管陆军）、黄天行（分管海军），参谋长蒋酬勤。
北太平洋舰队总部设在横须贺，防守范围包括日本岛、千岛群岛（1875年归属日本）、北海以及日本东.=>洋舰队（原北海舰队）为基础，陆军以海军陆战2（江苏调往日本的201师改编）为基础。司令马丁、副司令段瑞（分管陆军）、易江北（分管海军），参谋长萧长功。
西太平洋军区总部设在台湾基隆，防守范围包括台湾以及琉球群岛附近海域。海军方面以西太平洋舰队（原黄海舰队）为基础，陆军以海军陆战3（原卫三师）为主。司令舒畅，副司令李海强（原卫三师师长，分管陆军）、易江南（分管海军），参谋长丛克捷。
南海舰队战舰数量上没有改变，总部迁往越南沱囊港（现称港），以防守南部沿海为主要任务。正副司令分别为李爽、蔡廷干。
近卫军区陆军总部设在南京，由袁世凯直接指挥，除了担负守卫帝都的任务外，战时还可以其他对各个军区进行支援。海军方面以近卫舰队为基础，陆军以近卫师1师（原卫一师）为基础。海军司令肖羽，陆军司令王洛。另外袁韬和骕骁分队队长卢家驹同时被召入近卫军区，成为正在筹建的“特种装甲师”正副师长……
针对中国现阶段的国情，统帅部制定的国防战略是“以积极防御为主”，即以北方三大军区防御沙俄；以西南军区防御英国；以东太平洋军区警戒美国；以南海舰队、近卫舰队以及西、北太平洋军区组成海外防御岛链，守卫整个中国东南沿海安全。在这种战略思想的指导下，中华帝国采取了与满清“重京畿轻边关”完全不同的军事部署策略——将国防力量部署在边境与海岸线，御敌于国门之外！
由于中国漫长地海岸线和边界线，使得帝国现有的兵力相形见绌。为了完成积极防御的战略部署，统帅部制定了扩军的计划：第一阶段，在十年内以扩建陆军为主、海军为辅，并全力建设预备役制度。陆军方面，内陆四大军区总人数计划全部扩充到15万，使陆军总数.海军方面，海外三大军区海各自建立两个海军陆战师，使得海军陆战部士兵总数达到15万；近卫军区陆军计划扩编为四个师，总人.军方面，第一阶段只计划增加五至十艘水面主力战舰，而近海防御、辅助战舰要大量建造，潜艇部队十年争取扩充到150200！